موهای بتهوون سفر غیرمنتظره‌ای از یک قفل مو که از جسد بتهوون بریده شده را دنبال می‌کند و راز زندگی و مرگ عذاب‌آور او را کشف می‌کند. فیلم در زمان معاصر آغاز می‌شود، زمانی که یک جفت علاقه‌مند به بتهوون مو را در حراجی ساتبی خریداری می‌کنند. داستان سپس به مالکان قبلی این قفل مو می‌پردازد و به علمی که "راز پزشکی" بتهوون را فاش می‌کند، culminates می‌شود. با موسیقی باشکوهی از برخی از بهترین آثار بتهوون، فیلم دنیای آزمایش‌های پزشکی قانونی را در تضاد با رومانس وین قرن نوزدهم و وحشت‌های آلمان نازی در قرن بیستم بررسی می‌کند.